Details for gene set KEGG_TGF_BETA_SIGNALING

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_FC
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	KEGG_TGF_BETA_SIGNALING_PATHWAY
Enrichment Score (ES)	0.21044843
Normalized Enrichment Score (NES)	2.2331798
Nominal p-value	0.0019455253
FDR q-value	0.01953447
FWER p-Value	0.112

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	COMP	170	1.658	0.0026	Yes
2	GDF7	336	1.127	0.0055	Yes
3	GDF6	461	0.957	0.0105	Yes
4	BMP6	559	0.814	0.0171	Yes
5	INHBB	1060	0.496	0.0019	Yes
6	SMAD9	1270	0.417	0.0024	Yes
7	SMAD7	1314	0.399	0.0118	Yes
8	SMAD6	1442	0.358	0.0167	Yes
9	LEFTY2	1589	0.330	0.0206	Yes
10	IFNG	1662	0.317	0.0285	Yes
11	TNF	1751	0.302	0.0355	Yes
12	ID4	1912	0.273	0.0387	Yes
13	BMP2	1988	0.263	0.0464	Yes
14	BMP4	1989	0.263	0.0582	Yes
15	AMHR2	2110	0.249	0.0635	Yes
16	INHBE	2190	0.240	0.0710	Yes
17	AMH	2248	0.234	0.0797	Yes
18	THBS1	2481	0.211	0.0789	Yes
19	ID2	2578	0.204	0.0855	Yes
20	ZFYVE16	2632	0.199	0.0944	Yes
21	TGFBR1	2924	0.177	0.0905	Yes
22	BMPR2	3274	0.156	0.0834	Yes
23	LTBP1	3439	0.149	0.0863	Yes
24	DCN	3469	0.147	0.0965	Yes
25	THBS2	3583	0.141	0.1022	Yes
26	PPP2R1A	3675	0.136	0.1091	Yes
27	ROCK1	3771	0.132	0.1157	Yes
28	BMPR1A	4312	0.111	0.0984	Yes
29	RBL2	4446	0.107	0.1030	Yes
30	EP300	4571	0.102	0.1080	Yes
31	ROCK2	4671	0.098	0.1145	Yes
32	SMAD1	4924	0.091	0.1126	Yes
33	SMURF2	4989	0.089	0.1210	Yes
34	PPP2CA	5022	0.088	0.1310	Yes
35	MAPK1	5144	0.085	0.1362	Yes
36	SMURF1	5151	0.085	0.1477	Yes
37	RPS6KB1	5181	0.084	0.1579	Yes
38	BMP8A	5225	0.082	0.1673	Yes
39	CREBBP	5434	0.077	0.1679	Yes
40	ACVR2B	5511	0.075	0.1755	Yes
41	RHOA	5889	0.065	0.1670	Yes
42	SKP1	5977	0.062	0.1740	Yes
43	FST	6122	0.059	0.1780	Yes
44	SMAD5	6187	0.058	0.1864	Yes
45	SP1	6216	0.057	0.1966	Yes
46	CUL1	6347	0.054	0.2014	Yes
47	ZFYVE9	6810	0.044	0.1882	Yes
48	INHBA	7006	0.039	0.1895	Yes
49	SMAD2	7255	0.034	0.1879	Yes
50	TGFB1	7321	0.033	0.1961	Yes
51	PPP2R1B	7479	0.029	0.1994	Yes
52	RBL1	7504	0.029	0.2099	Yes
53	SMAD4	7713	0.025	0.2104	Yes
54	MAPK3	7950	0.020	0.2095	No
55	ACVR1	8320	0.013	0.2014	No
56	RPS6KB2	8451	0.010	0.2061	No
57	PPP2CB	8718	0.005	0.2035	No
58	RBX1	10323	-0.026	0.1288	No
59	ACVR2A	10629	-0.032	0.1241	No
60	TGFB2	10886	-0.039	0.1221	No
61	NOG	10936	-0.040	0.1312	No
62	TGFB3	11101	-0.044	0.1341	No
63	NODAL	11766	-0.060	0.1101	No
64	ACVRL1	12051	-0.066	0.1065	No
65	E2F4	12725	-0.084	0.0820	No
66	CHRD	12997	-0.092	0.0792	No
67	BMPR1B	13095	-0.095	0.0857	No
68	TFDP1	13204	-0.099	0.0917	No
69	SMAD3	13263	-0.101	0.1003	No
70	TGFBR2	13355	-0.104	0.1071	No
71	THBS3	13396	-0.105	0.1168	No
72	GDF5	13402	-0.105	0.1283	No
73	ID3	13510	-0.108	0.1342	No
74	E2F5	14221	-0.139	0.1077	No
75	BMP5	14367	-0.147	0.1117	No
76	MYC	14551	-0.156	0.1136	No
77	BMP8B	14826	-0.173	0.1106	No
78	CDKN2B	14900	-0.178	0.1184	No
79	ID1	15407	-0.219	0.1029	No
80	PITX2	16527	-0.383	0.0543	No
81	LEFTY1	16777	-0.446	0.0526	No
82	ACVR1C	16965	-0.495	0.0543	No
83	INHBC	16968	-0.496	0.0660	No
84	THBS4	17192	-0.576	0.0657	No
85	BMP7	18220	-1.454	0.0221	No